Chương trình đào tạo diễn ra từ ngày 25/11 đến ngày 06/12/2019 với thời lượng 64 tiết được chia thành 05 chuyên đề:  Kỹ năng kiểm toán tại các đơn vị dự toan cấp I và cấp II thuộc ngân sách trung ương; Kế toán NSNN và kiểm toán tại KBNN địa phương; Kỹ năng kiểm toán tại cơ quan tài chính; Kỹ năng kiểm toán công tác quản lý đầu tư công tại địa phương; Kỹ năng kiểm toán công tác quản lý thu NSNN tại địa phương (chia thành lĩnh vực Hải quan và lĩnh vực Thuế). Giảng viên của lớp học đều là các lãnh đạo cấp phòng, cấp Vụ có trình độ chuyên môn và giàu kinh nghiệm trong lĩnh vực ngân sách. Chương trình học trang bị những kiến thức, kỹ năng chuyên sâu cho học viên về lĩnh vực kiểm toán ngân sách nhà nước.

Phát biểu trong lễ khai giảng, Phó Giám đốc Trường Nguyễn Huy Hoàng chia sẻ đây là dịp cuối năm, các đơn vị đều đang tập trung tổng kết, tuy nhiên không vì thế mà chương trình học bị gián đoạn. Phó Giám đốc Trường đề nghị các học viên vẫn phải đảm bảo việc tham gia lớp học đầy đủ theo quy chế và kế hoạch.